RIOT-002ではRP605xxx4xが採用されており、その動作電圧下限は2.4Vだが、2次電池の下限電圧は1.8Vになっている。RIOT-002としては2.4Vまでしか動作しないのでしょうか？

RIoT環境センサー

いいえ、RP605自体はVIN電圧がUVLO検出電圧（Typ1.5V)までは動作し続けます。
ただ、2.4V以下になるとバッテリモニター機能の電圧（BM）の精度保証が出来なくなるため、推奨範囲としては2.4V～としています。
尚、本Boardでは前段のDCDC(R1801)のPG機能がVout=1.9V（Typ）以下でLowになる仕様ですので、本システムとしては動作するのは1.9Vまでです。